Очень, очень много что можно сделать в рамках схемы процедурной генерации. Фактически, можно было забабахать аналог Х-СОМа в космосе (нет, не на манер "Перехватчика"), только на порядок сложнее, с разведкой, сбором сведений, перехватами грузовых конвоев пришельцев, отражением атак на земные базы и конвои, нападениями на их базы (то есть добавить различные виды миссий, для которых понадобились бы различные типы кораблей, и которые невозможно было бы осуществить в одиночку), исследованием их груза, кораблей и оружия и изготовлением усовершенствованного земного оружия. В областях, подконтрольных пришельцам, сделать их активной агрессивной атакующей силой, усердно перехватывающей игроков. Добавить вылазки пришельцев в близлежащие зоны и маловероятные произвольные вылазки их рейдеров везде, где они бы пытались перехватить и уничтожить игроков. Много всего можно придумать если только есть желание. Можно постепенно добавлять всё новые и новые виды деятельности, миссий, кораблей, оружия и так далее, менять тактику пришельцев...
Можно делать вменяемые события. Например, группа кораблей пришельцев, последовательно пролетая через все системы по пути из зоны пришельцев в зону людей, атаковала бы земную станцию в глубине "пузыря", взяла бы её на абордаж, похитила важную персону, потом потащила бы её обратно на свою базу в оккупированной ими области, и на каждом из этих этапов игроки, уведомлённые о событии при пересечении пришельцами границы области обитания людей, могли бы попытаться перехватить эту группу и отбить важную персону (в том числе включая нападение на инопланетную базу). Это я вот так, сходу привёл ОДИН пример, придуманный на коленке. Их должно быть МНОЖЕСТВО. Длинных, интересных сценариев, с постоянным добавлением новых...
В данный момент драчки с пришельцами - необязательная деятельность, инициатором которой может выступать только игрок. Также он может в любой момент выйти из боя. Строго говоря, пришелец ТОЖЕ мог бы в любой момент выйти из боя, если бы Фронтиры не зарезали ему инстинкт самосохранения в ноль. А ведь из одного только этого можно было бы сделать интересную механику, и исследованием инопланетных кораблей, разработкой соответствующего модуля или оружия, сбором материалов и/или компонентов, его усовершенствованием. И он был бы реально востребован в упомянутом мною выше примере сценария.